{"id":6197,"date":"2020-02-26T09:40:22","date_gmt":"2020-02-26T08:40:22","guid":{"rendered":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/archive_colloque\/seminaire-de-marc-bergdoll-institut-de-biologie-moleculaire-des-plantes\/"},"modified":"2024-03-26T17:06:25","modified_gmt":"2024-03-26T16:06:25","slug":"seminaire-de-marc-bergdoll-institut-de-biologie-moleculaire-des-plantes","status":"publish","type":"archive_colloque","link":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/archive_colloque\/seminaire-de-marc-bergdoll-institut-de-biologie-moleculaire-des-plantes\/","title":{"rendered":"S\u00e9minaire de Marc Bergdoll (Institut de biologie mol\u00e9culaire des plantes)"},"content":{"rendered":"<div id=\"basic-page-content\" class=\"page-content\">    <div class=\"content\">    <div class=\"container-fluid\">      <div class=\"row\">                  <div class=\"container clearfix\">            <div class=\"row\">              <div class=\"col-xs-12\">                              <\/div>            <\/div>          <\/div>                                  <div class=\"body container\">            <div class=\"field field-name-body field-type-text-with-summary field-label-hidden\"><div class=\"field-items\"><div class=\"field-item even\" property=\"content:encoded\"><p class=\"rtejustify\">Titre : Phylog\u00e9nie structurale ou la construction de l&#8217;histoire de g\u00e8nes \u00e0 partir de structures de prot\u00e9ines.<\/p><p class=\"rtejustify\">R\u00e9sum\u00e9 : Comme C. Chothia et A. Lesk l&#8217;avaient mis en e\u0301vidence, de\u0300s 1986, les structures des prote\u0301ines et plus particulie\u0300rement leurs repliements sont mieux conserve\u0301es au cours de l&#8217;e\u0301volution que leurs se\u0301quences. Cette proprie\u0301te\u0301 et l&#8217;imposante accumulation de structures prote\u0301iques re\u0301solues permet aujourd&#8217;hui d&#8217;enrichir le concept de \u00ab relation structure-fonction \u00bb et de lui adjoindre un volet \u00ab relation structure-phylog\u00e9nie \u00bb ayant pour but d&#8217;e\u0301tablir des phyloge\u0301nies structurales plus pre\u0301cises que des phyloge\u0301nies base\u0301es sur des alignements de se\u0301quences. Deux exemples seront pr\u00e9sent\u00e9s traitant de repliements canoniques tr\u00e8s r\u00e9pandus. Le premier est une famille b\u00e2tie sur la re\u0301pe\u0301tition, duplication\/fusion et re\u0301organisation d&#8217;un module \u03b2\u03b1\u03b2\u03b2\u03b2 d&#8217;environ soixante acides amine\u0301s. Le second cas pr\u00e9sent\u00e9 concernera un module tr\u00e8s r\u00e9pandu dans le contexte des capsides virales: le domaine structural appel\u00e9 jelly-roll. Ces deux exemples concernent des superfamilles tr\u00e8s diff\u00e9rentes mais pr\u00e9sentant un certain nombre de points communs : i) chacune est tr\u00e8s peupl\u00e9e, ii) au sein de chacune d&#8217;elle les similarite\u0301s de se\u0301quences sont quasiment inde\u0301tectables, iii) le repliement est conserv\u00e9 et iv) chacune d\u00e9rive d&#8217;un ance\u0302tre unique en suivant des chemins, des histoires, complexes.<\/p><\/div><\/div><\/div>            <\/div>                      <\/div>    <\/div>  <\/div><\/div>","protected":false},"featured_media":4489,"parent":0,"template":"","class_list":["post-6197","archive_colloque","type-archive_colloque","status-publish","has-post-thumbnail","hentry"],"acf":{"id_old":"2577","date_seminaire":"2020-03-05 00:00:00","date_limite":null,"ville":"Marseille, amphi Oc\u00e9anomed"},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/archive_colloque\/6197","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/archive_colloque"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/archive_colloque"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/4489"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=6197"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}