{"id":7308,"date":"2022-02-09T08:32:33","date_gmt":"2022-02-09T07:32:33","guid":{"rendered":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/archive_page\/jour-11\/"},"modified":"2022-02-09T08:32:33","modified_gmt":"2022-02-09T07:32:33","slug":"jour-11","status":"publish","type":"archive_page","link":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/jour-11\/","title":{"rendered":"Jour 11"},"content":{"rendered":"
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10 f\u00e9vrier 2022<\/h2> <\/div>

En ce moment, le laboratoire tourne\u00a0jour et nuit : Rosette, Marine Snow Catcher,\u00a0Filet \u00e0 plancton, Colonisateurs, Sediment Trap.. Les \u00e9quipes ont \u00e9t\u00e9 tr\u00e8s efficaces,\u00a0m\u00eame si au prix de leur sommeil.
Nous aimerions tout vous partager en temps r\u00e9el mais la connexion en mer et le rythme \u00e0 bord demandent un peu de patience !<\/p>

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Marine Snow Catcher (MSC)<\/strong><\/p>

La neige marine fascine… et de ce fait le MSC ne connait pas beaucoup de repos!\u00a0Les \u00e9quipes non plus… Les \u00e9chantillonnages\u00a0se font de jour comme de nuit \u00e0 des profondeurs diff\u00e9rentes pour avoir un maximum de donn\u00e9es sur les particules.
Pauline s’exerce au laboratoire \u00e0 travers ces protocoles de pr\u00e9l\u00e8vement aux cot\u00e9s de Marc, Chlo\u00e9, Sophie et Najib.<\/p>

Pour rappel, le MSC permet de capturer 100L d’eau dans une\u00a0zone souhait\u00e9e et s\u00e9pare ensuite les particules en fonction de leur vitesse de chute. Apr\u00e8s\u00a0d\u00e9cantation, trois parties sont diff\u00e9renci\u00e9es : les suspendues (qui\u00a0flottent), les slow sinking (qui coulent doucement) et les fast sinking (qui coulent rapidement au fond). La vitesse de chute des particules d\u00e9pend\u00a0de leur\u00a0densit\u00e9.
L’\u00e9quipe\u00a0s’int\u00e9resse aux bact\u00e9ries qui vivent sur la neige marine. Ils aimeraient d\u00e9crire les communaut\u00e9s bact\u00e9riennes associ\u00e9es aux particules selon leur vitesse de chute pour mieux comprendre la pompe biologique de carbone qu’elles repr\u00e9sentent.
Gr\u00e2ce au MSC, ils peuvent pr\u00e9lever des \u00e9chantillons des bact\u00e9ries pr\u00e9sentes sur les particules d’un \u00e9tage de la colone d’eau\u00a0(suspendues, slow sinking, fast sinking).<\/p> <\/div> <\/div>

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Alors ils fonctionnent ces grigris?<\/strong><\/p>

L’\u00e9quipe s’occupe des trois parties : suspendues, slow sinking et fast sinking ; en appliquant \u00e0 chaque fois la m\u00eame m\u00e9thode.
Ils font passer la quantit\u00e9 d’eau concern\u00e9e dans une pompe qui diffuse doucement l’eau \u00e0 travers des filtres\u00a0de mailles diff\u00e9rentes. Les particules sont filtr\u00e9es selon leur taille ce qui\u00a0permet d’obtenir un deuxi\u00e8me \u00e9chantillonnage. Les particules de neige marine peupl\u00e9es de micro-ogranismes seront\u00a0\u00e9tudi\u00e9es au labo du MIO \u00e0 Marseille.<\/p>

Les chercheurs tenteront d’identifier les esp\u00e8ces bact\u00e9riennes pr\u00e9sentes dans les couches de particules \u00e0 l’aide de leurs g\u00e8nes. Pour cela, les bact\u00e9ries seront lys\u00e9es (cass\u00e9es), et seul leur mat\u00e9riel g\u00e9n\u00e9tique sera conserv\u00e9. Une fois extrait, l’acide nucl\u00e9ique (ADN, ARN) sera compar\u00e9 aux g\u00e8nes r\u00e9p\u00e9rtori\u00e9s dans une\u00a0banque de donn\u00e9es qui conserve les archives g\u00e9n\u00e9tiques de\u00a0micro-organismes d\u00e9j\u00e0 \u00e9tudi\u00e9s.
Les bact\u00e9ries sont d’une part d\u00e9finies par\u00a0des g\u00e8nes communs au monde bact\u00e9rien et d’autre part par des g\u00e8nes plus sp\u00e9cifiques, communs \u00e0 une esp\u00e8ce de bacterie. Les chercheurs se serviront de ce dernier rep\u00e8re pour les identifier !<\/p>

La chance qui \u00e9mane des grigris de Chlo\u00e9 les conduira peut \u00eatre \u00e0 d\u00e9couvrir des esp\u00e8ces bact\u00e9riennes jamais encore d\u00e9crites !<\/p> <\/div> <\/div>

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Le Sediment Trap<\/strong><\/p>

Ce dr\u00f4le d’outil fait partie de la panoplie\u00a0de nos microbiologistes oc\u00e9anologues\u00a0\u00e0 bord. C’est un pi\u00e8ge \u00e0 particules\u00a0qui,\u00a0tout comme\u00a0le Marine Snow Catcher, permet d’\u00e9chantillonner des particules\u00a0dans l’eau. Seulement, il ne pr\u00e9l\u00e8ve\u00a0pas une zone de l’eau, mais il capture les flocons de neige marine durant leur chute.\u00a0Le sediment trap est immerg\u00e9 \u00e0 la profondeur voulu et laiss\u00e9 le nombre d’heures souhait\u00e9es. Il retient les particules de neige marine dans leur descente \u00e0 l’int\u00e9rieur de ces 4 tubes (photo).<\/p>

Chlo\u00e9 a ing\u00e9nieusement d\u00e9velopp\u00e9 un gel\u00a0pour pi\u00e9ger les particules. Elle en\u00a0dispose une tranche dans chacun des tubes avant leur immersion, et les particules atterrissent naturellement dessus. Une fois qu’elles ont p\u00e9n\u00e9tr\u00e9\u00a0dans le gel, elles sont\u00a0captur\u00e9es!\u00a0Ce gel a des propri\u00e9t\u00e9s chimiques qui figent toute activit\u00e9 biologique des micro organismes et Chlo\u00e9 peut ainsi r\u00e9cup\u00e9rer\u00a0les particules une par une et les \u00e9tudier s\u00e9par\u00e9ment.
Contrairement aux \u00e9tudes qui suivent le\u00a0Marine Snow Catcher, celle-ci permet d’\u00e9tudier la communaut\u00e9 bact\u00e9rienne pr\u00e9sente sur chaque particule de neige marine pr\u00e9lev\u00e9e.\u00a0<\/p> <\/div> <\/div>

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Le Nautile toujours en action<\/strong><\/p>

Les \u00e9quipes \u00e0 bord du navire ne s’arr\u00eatent pas, il en va de m\u00eame pour les \u00e9quipes du Nautile sous l’eau ! Les missions sur le site EMSO-LO se poursuivent tant que la houle le permet.\u00a0
Des infrastructures\u00a0du fond n\u00e9cessitent encore d’\u00eatre d\u00e9plac\u00e9es, branch\u00e9es ou\u00a0d\u00e9ploy\u00e9es. La mise \u00e0 l’eau des appareils n’est qu’une premi\u00e8re \u00e9tape dans leur mise en place.
Les op\u00e9rations du Nautile sont longues et minutieuses, mais jusqu’ici guid\u00e9es par le succ\u00e8s\u00a0!\u00a0<\/p> <\/div> <\/div>

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\u2190 Jour pr\u00e9c\u00e9dent<\/strong><\/a><\/p> <\/div> <\/div>

Jour suivant \u2192<\/strong><\/a><\/p> <\/div> <\/div> <\/div> <\/div> <\/div><\/section><\/div><\/div><\/div><\/div> <\/div> <\/div> <\/div> <\/div><\/div>","protected":false},"featured_media":4489,"parent":0,"template":"","class_list":["post-7308","archive_page","type-archive_page","status-publish","has-post-thumbnail","hentry"],"acf":{"id_old":"3614","category_old":"EMSO-LO \/ BathyCruise"},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/archive_page\/7308","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/archive_page"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/archive_page"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/4489"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=7308"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}