{"id":22332,"date":"2025-07-15T11:13:34","date_gmt":"2025-07-15T09:13:34","guid":{"rendered":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/?p=22332"},"modified":"2025-07-15T14:29:22","modified_gmt":"2025-07-15T12:29:22","slug":"these-paul-estoup","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/these-paul-estoup\/","title":{"rendered":"F\u00e9licitations \u00e0 Paul Estoup (MIO MEB) qui a soutenu sa th\u00e8se le mardi 15 juillet 2025"},"content":{"rendered":"\t\t
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Sur le sujet : Structure, diversit\u00e9 et interactions du microbiote associ\u00e9 \u00e0 la culture d\u2019Ulva lacinulata : vers une compr\u00e9hension multi-r\u00e8gnes de l\u2019holobionte ulve.<\/em><\/p>

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R\u00e9sum\u00e9<\/strong><\/h4>

Les ulves sont des macroalgues vertes connues pour leurs efflorescences massives (\u00abmar\u00e9es vertes \u00bb) en milieu littoral souvent li\u00e9es \u00e0 l\u2019eutrophisation d\u2019origine anthropique. Elles entra\u00eenent des impacts environnementaux et socio-\u00e9conomiques majeurs. Parall\u00e8lement, l\u2019ulve suscite un int\u00e9r\u00eat croissant en aquaculture en raison de sa culture ais\u00e9e et de ses perspectives de valorisation. L\u2019ulve forme un holobionte o\u00f9 la communaut\u00e9 microbienne associ\u00e9e influence fortement sa physiologie. Si le r\u00f4le des bact\u00e9ries associ\u00e9es \u00e0 l\u2019ulve est \u00e9tudi\u00e9 depuis une quarantaine d\u2019ann\u00e9es, la composante globale de l\u2019holobionte, incluant eucaryotes et virus, demeure encore peu explor\u00e9e. Dans ce contexte, mon travail s\u2019appuie sur un syst\u00e8me exp\u00e9rimental de culture \u00e0 haut rendement algal, utilis\u00e9 pour de la production de biomasse d\u2019ulve. Deux r\u00e9gimes de culture contrast\u00e9s ont \u00e9t\u00e9 compar\u00e9s : un apport continu d\u2019eau de mer naturelle et un apport d\u2019eau de mer enrichie en nitrate ou ur\u00e9e et phosphate en mode batch. Nous avons caract\u00e9ris\u00e9 trois composantes du microbiote associ\u00e9 \u00e0 Ulva lacinulata : (i) les communaut\u00e9s bact\u00e9riennes, (ii) les eucaryotes, toutes deux analys\u00e9es dans le biofilm de surface de l\u2019ulve et dans l\u2019eau de culture, et (iii) la fraction virale \u00e0 ADN double brin, \u00e9tudi\u00e9e uniquement dans l\u2019eau environnante. L\u2019enrichissement des cultures a un effet de remodelage des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes, avec l\u2019\u00e9mergence de taxons opportunistes impliqu\u00e9s dans le m\u00e9tabolisme de l\u2019azote. Un core microbiote bact\u00e9rien persiste dans les deux conditions, sugg\u00e9rant son r\u00f4le central au sein de l\u2019holobionte. L\u2019eau de culture contient une large diversit\u00e9 de virus \u00e0 ADN eucaryotes (~750 entit\u00e9s), pour la plupart inconnus ou peu d\u00e9crits dans le milieu marin et chez l\u2019ulve. La diversit\u00e9 des eucaryotes est peu affect\u00e9e par l\u2019enrichissement en nutriments et des liens potentiels entre certains virus et leurs h\u00f4tes eucaryotes sont identifi\u00e9s par des analyses de cooccurrence. Cette \u00e9tude propose une vision multi-r\u00e8gnes de l\u2019holobionte Ulva lacinulata et ouvre la voie \u00e0 une compr\u00e9hension plus fine de sa dynamique dans un contexte d\u2019efflorescence environnementale suite \u00e0 un \u00e9v\u00e8nement d\u2019eutrophisation.<\/p>

\u00a0<\/p>

Mots cl\u00e9s<\/strong><\/h4>

Ulva lacinulata, Holobionte, Virus, Bact\u00e9ries, Eucaryotes, Efflorescences massives<\/p>

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Composition du jury<\/strong><\/h4>
  • Lucie ZINGER Rapporteuse MCF, Sorbonne, CRBE<\/li>
  • Phillipe ROUMAGNAC Rapporteur DR, Cirad<\/li>
  • Christophe LEBOULANGER Examinateur CR, MARBEC<\/li>
  • Val\u00e9rie MICHOTEY Pr\u00e9sidente du jury PR, MIO<\/li>
  • Ang\u00e9lique GOBET Co-directrice de th\u00e8se CR, MARBEC<\/li>
  • Guillaume BLANC Co-directeur de th\u00e8se DR, MIO<\/li><\/ul>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t
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    Sur le sujet : Structure, diversit\u00e9 et interactions du microbiote associ\u00e9 \u00e0 la culture d\u2019Ulva lacinulata : vers une compr\u00e9hension multi-r\u00e8gnes de l\u2019holobionte ulve. R\u00e9sum\u00e9 Les ulves sont des macroalgues […]<\/p>\n","protected":false},"author":319,"featured_media":22898,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[26],"tags":[],"class_list":["post-22332","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-theses"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/22332","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/319"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=22332"}],"version-history":[{"count":16,"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/22332\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":22900,"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/22332\/revisions\/22900"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/22898"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=22332"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=22332"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=22332"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}