{"id":6662,"date":"2021-03-03T08:58:28","date_gmt":"2021-03-03T07:58:28","guid":{"rendered":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/formation-a-lanalyse-bio-informatique\/"},"modified":"2021-03-03T08:58:28","modified_gmt":"2021-03-03T07:58:28","slug":"formation-a-lanalyse-bio-informatique","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/formation-a-lanalyse-bio-informatique\/","title":{"rendered":"Formation \u00e0 l\u2019analyse bio-informatique"},"content":{"rendered":"
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L\u2019Institut de recherche pour le d\u00e9veloppement (IRD) a arbitr\u00e9 favorablement le projet structurant de formation (PSF) BIODIV 2021-2023 \u00e9tabli en partenariat avec l\u2019Institut Sup\u00e9rieur des Sciences Biologiques Appliqu\u00e9es de Tunis (ISSBAT), la Facult\u00e9 des Sciences de Tunis (FST), et l\u2019Institut National des Sciences et Technologies de la Mer (INSTM).<\/p>

Ce dispositif de formation sur trois ans a pour objectif de d\u00e9velopper, renforcer et p\u00e9renniser des comp\u00e9tences bio-informatiques au niveau des institutions de l\u2019enseignement sup\u00e9rieur et des \u00e9quipes de recherche partenaires tunisiennes.<\/p>

Le Dr. Fabrice Armougom (IRD) rattach\u00e9 \u00e0 l\u2019Institut M\u00e9diterran\u00e9en d\u2019Oc\u00e9anologie (UM 110) et porteur de ce projet structurant de formation, nous d\u00e9crit ce programme.<\/p>

Pourquoi la bio-informatique est-elle au c\u0153ur de ce projet ?<\/p>

La bio-informatique est aujourd\u2019hui un outil incontournable en sciences biologiques et environnementales. Elle est par exemple un maillon essentiel dans l\u2019identification de nouveaux pathog\u00e8nes, de biomarqueurs, ou encore dans l\u2019\u00e9tude de la diversit\u00e9 taxonomique et fonctionnelle des \u00e9cosyst\u00e8mes. Sa pr\u00e9sence au c\u0153ur du projet r\u00e9side aussi dans le fait que c\u2019est une jeune discipline, d\u00e9licate \u00e0 appr\u00e9hender car elle combine les math\u00e9matiques, l\u2019informatique, la bio-statistique et la biologie.<\/p>

Pourquoi avoir mont\u00e9 ce projet de formation ?<\/p>

Nous avons mont\u00e9 ce projet car il r\u00e9pond aux besoins croissants en analyse bio-informatique, identifi\u00e9s et clairement formul\u00e9s par les structures de recherche (ISSBAT, INSTM) partenaires du MIO ou syst\u00e8me universitaire (FST) tunisiens. Parmi l\u2019ensemble des besoins et dans un contexte de changement climatique et d\u00e9mographique, nous proposons notamment un atelier d\u00e9di\u00e9 au s\u00e9quen\u00e7age haut d\u00e9bit et \u00e0 l\u2019exploration de la biodiversit\u00e9 microbienne pour la transition \u00e9nerg\u00e9tique (LMI BIOTEC H2), ou en r\u00e9ponse aux perturbations environnementales et anthropiques (LMI Cosys-Med).<\/p>

Quels sont les profils concern\u00e9s ?<\/p>

Notre PSF est un dispositif d\u2019appui \u00e0 la formation universitaire et aux structures de recherche. La population scientifique concern\u00e9e est par cons\u00e9quent tr\u00e8s h\u00e9t\u00e9rog\u00e8ne. Au niveau universitaire, notre action de formation s\u2019effectuera aupr\u00e8s des \u00e9tudiants en Masters et doctorants de l\u2019ISSBAT de la FST, et de l\u2019INSTM. Au niveau des structures de recherche partenaires, nous accueillerons et formerons par ce dispositif des ing\u00e9nieurs, chercheurs et enseignants-chercheurs.<\/p>

Hana Gannoun, ma\u00eetre assistante \u00e0 l\u2019Institut sup\u00e9rieur des sciences biologiques appliqu\u00e9es de Tunis (ISSBAT) nous explique son investissement dans ce projet.<\/p>

De quelle mani\u00e8re l\u2019Institut sup\u00e9rieur des sciences biologiques appliqu\u00e9es de Tunis (ISSBAT) est-il impliqu\u00e9 ?<\/p>

Un grand nombre de doctorats et d\u2019enseignants chercheurs ont exprim\u00e9 leur int\u00e9r\u00eat de participer \u00e0 ces ateliers de formation. C\u2019est dans ce sens que l\u2019ISSBAT s\u2019est engag\u00e9e dans ce projet afin d\u2019assurer la mise en place en premier lieu d\u2019une formation p\u00e9renne en bio-informatique pour les doctorants et enseignants-chercheurs impliqu\u00e9s dans ce projet et pour am\u00e9liorer les comp\u00e9tences des \u00e9tudiants en cours de formation en deuxi\u00e8me lieu.<\/p>

Pour le faire, l\u2019ISSBAT veillera \u00e0 assurer l\u2019organisation et la mise en place de ces formations et mettra \u00e0 la disposition de ce projet toute l\u2019infrastructure (salle informatique, mat\u00e9riel informatique, r\u00e9seau et connexion internet\u2026) et les moyens logistiques n\u00e9cessaires (salle des conf\u00e9rences, \u00e9quipement audio-visuel, etc.) et veillera \u00e0 bien mener toutes les actions programm\u00e9es dans le cadre de ce projet.\u00a0<\/p>

Quels sont les apports pour la recherche tunisienne, \u00e0 court, moyen et long termes ?<\/p>

La bio-informatique est devenue un domaine de formation et un outil analytique incontournable dans les universit\u00e9s et les instituts de recherches. C\u2019est un domaine de recherche en plein d\u00e9veloppement qui est \u00e0 l\u2019intersection de plusieurs disciplines dont l\u2019objectif essentiel est de r\u00e9pondre \u00e0 des questions biologiques en utilisant les s\u00e9quences et les informations biologiques relatives \u00e0 ces s\u00e9quences.<\/p>

A court terme, ce dispositif de formation permettra d\u2019un c\u00f4t\u00e9 de mettre en place une salle fonctionnelle et d\u00e9di\u00e9e \u00e0 l\u2019analyse bio-informatique \u00e0 l\u2019ISSBAT et d\u2019un autre c\u00f4t\u00e9, il permettra d\u2019approfondir le savoir-faire des \u00e9tudiants et des jeunes chercheurs tunisiens dans le domaine bio-informatique \u00e0 travers des ateliers th\u00e9oriques et pratiques.<\/p>

A moyen et \u00e0 long terme, le savoir-faire acquis en bio-informatique permettra non seulement d\u2019avoir des comp\u00e9tences dans ce domaine mais aussi de s\u2019en servir dans la recherche dans le domaine de la g\u00e9nomique appliqu\u00e9e \u00e0 l\u2019environnement (exploration de la biodiversit\u00e9 microbienne pour la valorisation \u00e9nerg\u00e9tique de la biomasse pour la transition \u00e9nerg\u00e9tique, ou en r\u00e9ponse aux variations environnementales et\u00a0 anthropiques ) et \u00e0 la sant\u00e9 (\u00e9tude \u00e9pid\u00e9miologique, maladies g\u00e9n\u00e9tiques et m\u00e9taboliques, etc.).<\/p>

Partenaires :<\/p>

Facult\u00e9 des Sciences de Tunis (FST), Universit\u00e9 de Tunis El Manar,
Institut de recherche pour le d\u00e9veloppement (IRD),
Institut M\u00e9diterran\u00e9en d\u2019Oc\u00e9anologie (MIO),
Institut National des Sciences et Technologies de la Mer (INSTM),
Institut Pasteur de Tunis (IPT),
Institut Sup\u00e9rieur des Sciences Biologiques Appliqu\u00e9es de Tunis (ISSBAT), Universit\u00e9 de Tunis El Manar,
Laboratoire de Biochimie et Biotechnologie (LBB),
Laboratoire des Mat\u00e9riaux de l\u2019Environnement pour le D\u00e9veloppement Durable (LMEDD),
Laboratoire des Micro-organismes et Biomol\u00e9cules Actives (LMBA),
Laboratoire Mixte International BIOTEC H2 (LMI BIOTEC H2),
Laboratoire Mixte International Cosys-Med (LMI Cosys-Med).<\/p><\/div><\/div><\/div> <\/div> <\/div> <\/div> <\/div> <\/div><\/div>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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