{"id":6679,"date":"2021-05-06T12:22:59","date_gmt":"2021-05-06T10:22:59","guid":{"rendered":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/felicitations-a-lauric-reynes-embio-qui-a-soutenu-sa-these-en-presentiel-et-par-visioconference-le-mardi-1er-juin-2021-a-1400-amphitheatre-oceanomed\/"},"modified":"2021-05-06T12:22:59","modified_gmt":"2021-05-06T10:22:59","slug":"felicitations-a-lauric-reynes-embio-qui-a-soutenu-sa-these-en-presentiel-et-par-visioconference-le-mardi-1er-juin-2021-a-1400-amphitheatre-oceanomed","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/felicitations-a-lauric-reynes-embio-qui-a-soutenu-sa-these-en-presentiel-et-par-visioconference-le-mardi-1er-juin-2021-a-1400-amphitheatre-oceanomed\/","title":{"rendered":"F\u00e9licitations \u00e0 Lauric Reynes (EMBIO ) qui a soutenu sa th\u00e8se en pr\u00e9sentiel et par visioconf\u00e9rence le mardi 1er Juin 2021 \u00e0 14:00 (Amphith\u00e9\u00e2tre OCEANOMED,"},"content":{"rendered":"
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Sur le sujet suivant :<\/p>

“Connectivit\u00e9 et structure g\u00e9n\u00e9tiques des populations d’Ericaria zosteroides (Fucales) et Laminaria rodriguezii (Laminariales) des c\u00f4tes fran\u00e7aises”
Directeur de th\u00e8se : Thierry Thibault, MCF AMU
Co directeur : Didier Aurelle, MCF AMU<\/p>

Les for\u00eats d\u2019algues brunes (Phaeophyceae)\u00a0; ordres des Laminariales (kelp) et des Fucales (Cystoseira, Sargassum, Ericaria, Gongolaria, Fucus pour la M\u00e9diterran\u00e9e) sont soumises \u00e0 des combinaisons de pressions d\u2019origine anthropique. La r\u00e9ponse des for\u00eats marines est n\u00e9anmoins hautement variable selon les esp\u00e8ces et les populations consid\u00e9r\u00e9es, mais \u00e9galement selon les causes de leur d\u00e9clin. Le devenir de ces \u00e9cosyst\u00e8mes d\u00e9pendra de la capacit\u00e9 des populations de ces esp\u00e8ces \u00e0 \u00e9voluer dans cet environnement changeant.<\/p>

A travers ma th\u00e8se, j\u2019ai \u00e9tudi\u00e9 les facteurs susceptibles de contr\u00f4ler la structure et la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tiques des for\u00eats marines en me focalisant sur deux esp\u00e8ces end\u00e9miques du bassin M\u00e9diterran\u00e9en, la Fucale Ericaria zosteroides et le kelp des milieux profonds Laminaria rodriguezii. Ces esp\u00e8ces peuvent former de vastes for\u00eats marines, d\u2019une grande valeur \u00e9cologique et socio-\u00e9conomique. Elles sont caract\u00e9ris\u00e9es par une distribution \u00e9parse et un faible potentiel de dispersion, avec des cons\u00e9quences potentielles sur leur r\u00e9ponse au changement global.<\/p>

Dans une premi\u00e8re partie, je me suis int\u00e9ress\u00e9 \u00e0 la connectivit\u00e9 des populations par une m\u00e9thode de s\u00e9quen\u00e7age partiel du g\u00e9nome (RAD-seq). L\u2019analyse de la structure g\u00e9n\u00e9tique indique une forte diff\u00e9renciation g\u00e9n\u00e9tique \u00e0 de courte distance et une connectivit\u00e9 r\u00e9duite, que ce soit pour les populations de E. zosteroides ou L. rodriguezii. En couplant structure g\u00e9n\u00e9tique et mod\u00e9lisation des courants marins, j\u2019ai \u00e9tudi\u00e9 le r\u00f4le de la dispersion des propagules en prenant comme cas d\u2019\u00e9tude, les populations de E. zosteroides en Provence. Les r\u00e9sultats obtenus montrent que la structure g\u00e9n\u00e9tique est davantage pr\u00e9dite par les courants marins que par l\u2019isolement spatial. Cela supporte l\u2019hypoth\u00e8se que la d\u00e9rive de rameaux fertiles peut \u00eatre un vecteur de flux de g\u00e8nes. Par ailleurs, le RAD-seq a permis de d\u00e9tecter des locus outliers qui pourraient \u00eatre impliqu\u00e9s dans l\u2019adaptation locale \u00e0 la profondeur.<\/p>

Dans une deuxi\u00e8me partie, je me suis int\u00e9ress\u00e9 au mode de reproduction du kelp L. rodriguezii, cette esp\u00e8ce \u00e9tant l\u2019une des rares du genre Laminaria \u00e0 se reproduire par reproduction v\u00e9g\u00e9tative et sexu\u00e9e. La clonalit\u00e9 partielle, en interaction avec d\u2019autres forces \u00e9volutives, telles que la d\u00e9rive g\u00e9n\u00e9tique et les mutations contr\u00f4lent l\u2019\u00e9volution de la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique. Ici, j\u2019ai employ\u00e9 le RAD-seq pour \u00e9tudier \u00e0 l\u2019\u00e9chelle du g\u00e9nome les signatures de la clonalit\u00e9. Les r\u00e9sultats obtenus confirment l\u2019impact de la clonalit\u00e9 sur la diversit\u00e9 g\u00e9nomique de L. rodriguezii, avec des niveaux variables selon les populations. La comparaison avec une esp\u00e8ce cong\u00e9n\u00e9rique \u00e0 reproduction sexu\u00e9e (Laminaria digitata) montre que d\u2019autres facteurs, notamment la d\u00e9rive g\u00e9n\u00e9tique peuvent avoir des effets confondants.<\/p>

Outre les questionnements fondamentaux soulev\u00e9s par ces r\u00e9sultats, l\u2019existence d\u2019une forte structure g\u00e9n\u00e9tique \u00e0 courte distance pour des populations \u00e9parses, a des implications importantes pour la conservation de ces esp\u00e8ces.<\/p><\/div><\/div><\/div> <\/div> <\/div> <\/div> <\/div> <\/div><\/div>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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