{"id":6973,"date":"2023-07-26T08:14:21","date_gmt":"2023-07-26T06:14:21","guid":{"rendered":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/felicitations-a-fatima-ababou-cybele-qui-a-soutenu-sa-these-le-25-juillet-2023\/"},"modified":"2023-07-26T08:14:21","modified_gmt":"2023-07-26T06:14:21","slug":"felicitations-a-fatima-ababou-cybele-qui-a-soutenu-sa-these-le-25-juillet-2023","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.mio.osupytheas.fr\/fr\/felicitations-a-fatima-ababou-cybele-qui-a-soutenu-sa-these-le-25-juillet-2023\/","title":{"rendered":"F\u00e9licitations \u00e0 Fatima ABABOU (CYBELE) qui a soutenu sa th\u00e8se le 25 Juillet 2023"},"content":{"rendered":"
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Sur le sujet suivant : R\u00f4le des diazotrophes dans la pompe biologique \u00e0 carbone : \u00e9tude des processus d’agr\u00e9gation, d’export et de remin\u00e9ralisation<\/em><\/p>

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Composition du jury<\/strong><\/h4>

Jury<\/strong><\/p>

Directeur de these Mme Sophie BONNET Aix-Marseille universit\u00e9
Rapporteur Mme Ilana BERMAN-FRANK Universit\u00e9 de Ha\u00effa, ISRAEL
Rapporteur Mme Camila FERNANDEZ Sorbonne universit\u00e9. Laboratoire d’Oc\u00e9anographie Microbienne (LOMIC) – UMR 7621 CNRS-UPMC
CoDirecteur de these M. Fr\u00e9d\u00e9ric A. C. LE MOIGNE Universit\u00e9 de Brest. LEMAR, Laboratoire des Sciences de l\u0092Environnement Marin, UMR6539, CNRS, UBO, IFREMER, IRD, Plouzan\u00e9, Technop\u00f4le Brest-Iroise, France
Examinateur M. Matthieu BRESSAC Laboratoire d’Oc\u00e9anographie de Villefranche, LOV. UMR7093
Examinateur Mme France VAN-WAMBEKE Aix Marseille universit\u00e9. Mediterranean Institute of Oceanography (MIO).<\/p>

Invit\u00e9<\/strong> : Thierry MOUTIN Aix Marseille universit\u00e9. Mediterranean Institute of Oceanography (MIO)<\/p>

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R\u00e9sum\u00e9 de la th\u00e8se<\/strong><\/h4>

Dans les oc\u00e9ans (sub)tropicaux appauvris en azote et occupant ~60% de la surface de l\u0092oc\u00e9an global, les diazotrophes soutiennent >50% de la production primaire nouvelle gr\u00e2ce \u00e0 la fixation du diazote atmosph\u00e9rique (N2). Ce travail de th\u00e8se porte sur l\u0092\u00e9tude du devenir des diazotrophes dans l\u0092oc\u00e9an, et en particulier sur le processus d\u0092agr\u00e9gation, d\u0092export et de remin\u00e9ralisation afin d\u0092\u00e9valuer leur r\u00f4le potentiel dans la pompe biologique \u00e0 carbone (PCB). Les objectifs de cette th\u00e8se \u00e9taient: 1) D\u0092\u00e9tudier les m\u00e9canismes d\u0092agr\u00e9gation et d\u0092export des diazotrophes contrast\u00e9es sur les plans physiques, morphologiques et physiologiques. 2) De mesurer les taux de remin\u00e9ralisation du diazotrophe le plus r\u00e9pandu dans les oc\u00e9ans (sub)tropicaux (Trichodesmium) pendant sa chute vers l\u0092oc\u00e9an profond. 3) D\u0092identifier la composition du flux de carbone organique particulaire (POC) export\u00e9 dans un \u0091hotspot\u0092 de fixation de N2 et d\u00e9terminer la contribution des diazotrophes \u00e0 ce flux. (1) Une exp\u00e9rience de simulation de chute de diazotrophes en \u0091roller tanks\u0092 a permis de mesurer les taux d\u0092agr\u00e9gation et les vitesses de chute de quatre types de diazotrophes dont la taille (1-1000 \u00b5m), la morphologie (filamenteux vs. unicellulaires) et la physiologie (production de substances exopolym\u00e9riques, TEP) sont contrast\u00e9s. Cette \u00e9tude a montr\u00e9 que tous les diazotrophes ind\u00e9pendamment de leur taille, forme et physiologie formaient des agr\u00e9gats de tailles 7000-32014 \u03bcm et chutaient \u00e0 des vitesses de 92 \u00e0 >400 m j-1 . Les diazotrophes unicellulaires atteignaient des vitesses de chute comparables \u00e0 celles des diazotrophes filamenteux en raison de leur capacit\u00e9 \u00e0 former des agr\u00e9gats dans la m\u00eame gamme de taille. En revanche, les TEP produites par les diazotrophes n’augmentaient pas leur capacit\u00e9 d’agr\u00e9gation ni leurs vitesses de chute, ce qui sugg\u00e8re que leur propri\u00e9t\u00e9s chimiques peuvent \u00e9galement jouer un r\u00f4le important dans ces processus. (2) Dans une seconde \u00e9tude en roller tanks, nous avons simul\u00e9 la chute de Trichodesmium jusqu\u0092\u00e0 1000 m de profondeur, en pr\u00e9sence d’un consortium naturel de bact\u00e9ries h\u00e9t\u00e9rotrophes. Cette \u00e9tude a montr\u00e9 que 42% de sa biomasse d\u00e9riv\u00e9e \u00e9tait encore pr\u00e9sente \u00e0 la fin de l’exp\u00e9rimentation, sugg\u00e9rant une remin\u00e9ralisation bact\u00e9rienne incompl\u00e8te et une s\u00e9questration potentielle de cette biomasse dans l\u0092oc\u00e9an profond. (3) Une troisi\u00e8me \u00e9tude men\u00e9e sur le terrain dans le Pacifique tropical Sud-Ouest lors de l\u0092exp\u00e9dition oc\u00e9anographie TONGA, a permis d\u0092identifier et de classifier les particules export\u00e9es dans les couches profondes de l\u0092oc\u00e9an. Gr\u00e2ce aux traitements d’images des particules, cinq cat\u00e9gories ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9es : agr\u00e9gats f\u00e9caux, phytod\u00e9tritiques et mixtes, pelotes f\u00e9cales cylindriques et carcasses de zooplancton. Les agr\u00e9gats f\u00e9caux \u00e9taient les plus abondants, et dominaient le flux de POC avec une moyenne de 56\u00b128% du flux total de POC. Les carcasses de zooplancton \u00e9taient \u00e9galement abondantes et contribuaient \u00e0 24\u00b119% au flux de POC total, tandis que les pelotes f\u00e9cales cylindriques et les agr\u00e9gats mixtes contribuaient respectivement \u00e0 15\u00b114% et 5\u00b14%. En revanche, les agr\u00e9gats phytod\u00e9tritiques \u00e9taient tr\u00e8s peu abondants et contribuaient pour <1% au flux de POC total. Les estimations des efficacit\u00e9s d’export et de transfert de toutes les particules confondues \u00e9taient importantes \u00e0 1000 m, montrant la capacit\u00e9 de la r\u00e9gion \u00e0 s\u00e9questrer efficacement du POC. De plus, les analyses d\u0092images obtenues par microscopie confocale ont r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que la contribution des diazotrophes au flux de POC augmentait de 7% \u00e0 170 m \u00e0 51% \u00e0 1000 m, ce qui souligne les voies d\u0092export directes des diazotrophes vers l\u0092oc\u00e9an profond et leur r\u00f4le dans la PCB. Il devient donc urgent d\u0092int\u00e9grer ces voies dans les mod\u00e8les biog\u00e9ochimiques afin d\u0092am\u00e9liorer notre compr\u00e9hension de leur r\u00f4le dans la PCB dans l\u0092oc\u00e9an d\u0092aujourd\u0092hui et celui de demain qui sera plus chaud, plus stratifi\u00e9 et donc plus favorable \u00e0 la diazotrophie.<\/p>

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