Clément Coclet (équipe MEB) soutiendra sa thèse le mercredi 26 Juin à 13h30 au bâtiment M (Campus de La Garde).
Sur le sujet suivant :
"Impacts de la contamination multiple en éléments traces métalliques sur les communautés microbiennes dans un environnement côtier fortement anthropisé : la rade de Toulon"
sous la direction de Cédric Garnier , Jean-François Briand et Benjamin Misson
Résumé : La rade de Toulon est un écosystème côtier fortement anthropisé qui présente un gradient multiple de contamination en éléments traces métalliques, qui en fait un site atelier remarquable. Le couplage des campagnes de terrain et des expérimentations en laboratoire a permis d’étudier l’impact de la contamination métallique sur les communautés microbiennes planctoniques et en biofilm. L’utilisation de la chimie analytique, de la cytométrie en flux et du métabarcoding a permis d’étudier plusieurs aspects des communautés, comme l’abondance et la diversité taxonomique en réponse à la contamination métallique dans la rade de Toulon. Ainsi, les communautés d’ultraphytoplancton et de bactérioplancton ont montré une structuration spatiale forte le long des gradients métalliques. Les expérimentations en laboratoire ont montré que les ETMs jouaient un rôle important sur l’abondance et la diversité des communautés ultraplanctoniques, par des effets directs (toxicité) et indirects (couplage phytoplancton-bactérioplancton). La communauté microbienne de biofilm a été beaucoup moins impactée par les gradients métalliques dans la rade de Toulon que la communauté ultraplanctonique. En revanche, la communauté de biofilm a semblé influencée par sa proximité avec le compartiment sédimentaire, qui ont pu fournir des microorganismes colonisateurs lors d’épisodes de remise en suspension. En conclusion, les ETMs ont semblé avoir un impact sur l’ensemble des communautés microbiennes de la rade de Toulon avec toutefois, des variations d’influence selon le compartiment.
Mots clés : Éléments traces métalliques, communautés microbiennes, bactérioplancton, ultraphytoplancton, biofilm microbien, écosystème côtier, rade de Toulon