Félicitations à Aina Astorch-Cardona (MEB) qui a soutenu sa thèse le 30 octobre

Sur le sujet suivant : "Influence des variations environnementales sur la dynamique des communautés microbiennes des tapis marins riches en fer".

Le jury était composé de :

- Mme Maria Soledad GONI URRIZA (Maîtresse de conférences), Université de Pau et des Pays de l'Adour
- M. Karim BENZERARA (Directeur de recherche), IMPMC
- Mme Valérie CHAVAGNAC (Directrice de recherche), GET
- Mme Patricia BONIN (Directrice de recherche), MIO

- Mme Céline ROMMEVAUX (Chargé de Recherche), MIO
- M. David EMERSON (Professor), Bigelow Laboratory for Ocean Sciences

Résumé :

Cette thèse vise à comprendre l'influence des variations environnementales sur la dynamique des communautés microbiennes dans les tapis marins riches en fer. Pour cela, nous avons étudié les communautés microbiennes des tapis se développant dans deux environnements différents en termes d'origine et concentration en fer, le champ hydrothermal de Lucky Strike (LSHF) et l'observatoire EMSO-Ligure Ouest (EMLIG), ainsi que celles des colonisateurs microbiens. Afin d'analyser cette diversité, nous avons utilisé le metabarcoding du gène de l'ARNr 16S et nous avons quantifié l'abondance de différents groupes taxonomiques (y compris les Zetaproteobacteria) en utilisant des approches qPCR ou dPCR. Nous avons couplé ces analyses avec des données géochimiques provenant des fluides hydrothermaux associés aux tapis de LSHF, et nous avons étudié les différentes morphologies d'oxyhydroxydes de fer produites par les Zetaproteobacteria à l'aide du MEB. Nos résultats suggèrent que les communautés des tapis microbiens riches en fer des environnements hydrothermaux sont influencées par le fluide diffus qui les alimente, qui varie en fonction de la composition des fluides hydrothermaux associés et de la lithologie du substratum sur lequel ils se développent. En contexte non hydrothermal, les communautés bactériennes dépendent complètement du type de substratum sur lequel elles se forment. Les communautés sur métaux ou minéraux contenant du fer ressemblent plus à celles associées à la biocorrosion ou à l'altération minérale, respectivement. Enfin, nos résultats montrent que les Zetaproteobacteria sont des taxons clés dans la création de communautés associées à des matériaux ou des environnements riches en fer, et qu'elles sont aussi influencées par le type de substratum sur lequel elles se développent et par l'âge des tapis.